トラックバックに一言申す！

基本的に、トラックバックURLとエントリURLがそれぞれ違うという、構造上の問題点があるとは思いますが、トラックバックをする側としては、参照先に「あなたの記事を参照しましたよー」というのを送りつけるものだと思います。
まずは、ここを見てください。

儀礼的無関心という用語が流行ってました。私のリンクとトラックバックポリシーにもLvがあります。

• Lv0　言及に留める場合、リンクなしトラックバックなし
• Lv1　とりあえず、参照してもらいたい場合、リンクありトラックバックなし
• Lv3　参照について反論・異論がある場合、リンクありトラックバックあり

とまあ、およそ3段階に分けて使っています。
基本はリンクありなのはWebの基本だと思います。トラックバックだけの記事というのはただの広告です。実際に、リンク表記の無い場合は勝手に削除してますしね。
あくまでマナーの問題かと・・・。